Protein liên kết hộp TATA

Bách khoa toàn thư phanh Wikipedia

Bạn đang xem: su khac nhau giua tdp tbp la gi va chuc vu ra sao protein lien ket hop tata

Prôtêin link vỏ hộp TATA là một trong những loại prôtêin đặc hiệu chỉ link với đoạn nuclêôtit đem trình tự động "TATA..." bên trên vùng phát động của gen gọi là vỏ hộp TATA (TATA box). Sự link của prôtêin này thêm phần ra quyết định những bước đầu mang đến quy trình phiên mã xẩy ra được hay là không bao gồm ở loại vật nhân thực và vi trùng (nhân sơ).^[1]^[2]

Thuật ngữ này dịch kể từ vẹn toàn gốc giờ Anh "TATA-box Binding Protein" và vì thế ghi chép tắt là TBP. quý khách hàng lưu ý rằng chữ tắt này chỉ người sử dụng và hiểu theo gót nội hàm bên trên vô nghành nghề sinh học tập, cũng chính vì vô giờ Anh lúc bấy giờ thì TBP đem rộng lớn 100 nghĩa không giống nữa.^[3] Bên cạnh đó, vô sinh học tập phân tử, thì TBP còn là một ký hiệu của gen mã hoá prôtêin này, tức là gen mã hoá TATA-box binding protein. Chẳng hạn ở người, những mái ấm nghiên cứu và phân tích đang được xác lập được gen TBP ở lô-cut gen 6q27 (hình 2).^[4]

TBP (TATA-box binding protein) có tương đối nhiều loại không giống nhau và được tạo thành nhiều bọn họ, cho dù ở cả loại vật nhân thực và vi trùng (nhân sơ) đều sở hữu, tuy nhiên cấu hình và hoạt động và sinh hoạt không giống nhau thật nhiều, tuy vậy đều sở hữu tác dụng như là nhau là: TBP thêm phần ra quyết định những bước đầu mang đến enzym RNA-pôlymêraza tổ chức quy trình phiên mã, kể từ cơ gen mới mẻ thể hiện và sự sinh sống vô tế bào mới mẻ tiếp nối.^[5]

Sơ thiết bị bên trên nằm trong của hình 1 tế bào miêu tả vỏ hộp TATA vô quy trình chi phí khởi điểm phiên mã nhân thực là đoạn gold color, những nhân tố phiên mã TF (Trannscription Factor) là những miếng color tím, enzym RNA pôlymêraza là hình trứng color hồng, là sơ thiết bị tổng quát tháo cộng đồng mang đến phiên mã nhân thực. Hộp TATA thông thường nằm ở vị trí địa điểm 25 - 35 bp trước địa điểm chính thức phiên mã. Hộp TATA không những xác kim chỉ nan phiên mã của Pol (RNA-pôlymêraza), mà còn phải chứng thật mang đến nó mạch đơn nào là của gen là khuôn tuy nhiên Pol cần thiết phát âm nhằm phiên. Chính TBP (mảnh color đỏ) là "người" trước tiên quan sát TATA, link với địa điểm này và "lôi kéo" những prôtêin không giống (màu tím) vô, kể từ cơ tạo hình rời khỏi tinh vi chi phí khởi điểm phiên mã gom Pol sẵn sàng vô tiến trình khởi điểm phiên mã.

Xem thêm: kham pha 2 anh bun dau mam tom dep ngon mat nhin la muon an moi nhat

Cấu tạo[sửa | sửa mã nguồn]

Ở vi trùng, TBP khác hoàn toàn với ở nhân thực, thông thường được gọi là yếu tố sigma (σ factor). Yếu tố sigma chỉ là một trong những prôtêin khá nhỏ (vài chục kDa) link với RNA-pôlymêraza họp trở nên tinh vi được gọi là hôlô-enzym RNA-pôlymêraza (RNA polymerase holoenzyme).^[6] Xem cụ thể ở trang Yếu tố phiên mã cộng đồng và trang nhân tố sigma.
Ở loại vật nhân thực, TPB có tương đối nhiều loại, từng loại đem cấu trúc riêng rẽ, tuy nhiên rất có thể tế bào miêu tả cấu trúc cộng đồng như sau.^[7]^[8]^[9]
Nó bao gồm khoảng tầm 200 amino acid. Phía đầu C (cacbôxyl) của chuỗi khoảng tầm 70 - 80 amino acid tái diễn nhì phen, tạo nên cấu hình hình yên lặng ngựa thực hiện căng DNA ở đoạn này (hình 3); vùng này link thẳng với vỏ hộp TATA và tương tác với những nhân tố phiên mã không giống vô group nhân tố phiên mã cộng đồng. trái lại, phía đầu N (amin) thông thường thay cho thay đổi cả về chiều lâu năm và trình tự động, tuỳ theo gót loại Pol và tuỳ theo gót loại. Nghĩa là đầu C được bảo đảm cao vô tiến bộ hoá.^[10]
Cấu trúc tinh ma thể của vùng C-terminal / lõi của TBP ở người đã và đang được xác lập ở độ sắc nét 1,9 angstroms.

Các thực nghiệm ở S. cerevisiae đang được cho là sự cướp khu vực TBP của một số trong những kích thích Pol II đem đối sánh với hoạt động và sinh hoạt phiên mã và sự kết nối của TBP được kích ứng vì chưng những hóa học kích hoạt và những nhân tố phiên mã cộng đồng. TBP link không những với vỏ hộp TATA, tuy nhiên còn khiến cho cả tía loại Pol (Pol I, Pol II và Pol III) hoạt động và sinh hoạt bên trên gen không tồn tại vỏ hộp TATA.^[11]

Vai trò của TBP[sửa | sửa mã nguồn]

Ở vi trùng (nhân sơ), enzym RNA pôlymêraza (Pol) tự động phân biệt được vùng phát động (promotor), tuy nhiên nếu như thiếu thốn TBP (tức nhân tố sigma) thì nó ko dính vào vỏ hộp TATA được và ko dãn xoắn- tách mạch gen nguyên hình được, nên phiên mã ko thể tổ chức (xem thêm thắt trang Yếu tố phiên mã cộng đồng và trang nhân tố sigma).
Ở loại vật nhân thực, vỏ hộp TATA là một trong những chuỗi nuclêôtit cho thấy thêm điểm nào là enzym RNA pôlymêraza rất có thể chính thức phát âm và phiên mã gen. Nhưng mặc dù có tầm quan trọng cốt yếu, Pol (RNA pôlymêraza) lại không tồn tại kĩ năng phân biệt vỏ hộp TATA, nên cần cần thiết một tụ họp những phân tử gom nó phân biệt, tuy nhiên phân tử trước tiên phân biệt là TBP. Xem thêm thắt cụ thể ở trang Phức ăn ý chi phí khởi điểm phiên mã.
Khởi động phiên mã là một trong những trong mỗi bước cần thiết vô quy trình thể hiện gen. Gen không những được phiên mã, mà còn phải cần được phiên mã vô chính thời gian tuy nhiên tế bào sinh sống yên cầu, kể từ cơ những vượt lên trước trình sinh học tập vừa mới được tiến hành chính. Việc phiên mã yên cầu enzym RNA pôlymêraza (Pol). Có nhiều loại Pol (RNA pôlymêraza), tuy nhiên không tồn tại loại nào là đem kĩ năng tự động lập trọn vẹn nhằm chính thức phiên mã. Do cơ, Pol cần phải có sự trợ gom của đa số nhân tố gọi là nhân tố phiên mã cộng đồng.
Trong những nhân tố phiên mã cộng đồng ở cả loại vật nhân thực và loại vật nhân sơ, đều sở hữu TBP, tuy rằng có tương đối nhiều loại, không giống nhau nhiều cụ thể, tuy nhiên TBP là quan trọng nhằm "khởi động" phiên mã vô một tiến trình gọi là chi phí khởi điểm phiên mã.
Ở loại vật nhân sơ, có một loại TBP là tinh vi chi phí khởi điểm phiên mã, không tồn tại nó thì Pol ko hoạt động và sinh hoạt được.
Ở loại vật nhân thực, TBP là một trong những tè đơn vị chức năng của nhân tố phiên mã TFIID nhằm phát động phiên mã của gen mặc dù có hay là không đem vỏ hộp TATA. Xem cụ thể rộng lớn yếu tố này ở trang Yếu tố phiên mã cộng đồng. Do cơ, TBP (prôtêin link vỏ hộp TATA) vẫn là một dụng cụ phát động phiên mã.^[12]
Prôtêin link TATA (TBP) là một trong những nhân tố phiên mã cộng đồng link ví dụ với chuỗi DNA được gọi là vỏ hộp TATA. Trình tự động DNA này được nhìn thấy khoảng tầm địa điểm - 30 (tức là cặp base loại 30 tính ngược lên đầu 5' của địa điểm chính thức phiên mã (+1). TBP cùng theo với hàng loạt những nhân tố tương quan cho tới TBP, tạo thành TFIID, một nhân tố phiên mã cộng đồng tạo thành một trong những phần của tinh vi chi phí khởi điểm mang đến Poll II. Là một trong những số không nhiều những prôtêin vô tinh vi chi phí khởi điểm link DNA Theo phong cách đặc hiệu với trình tự động TATA, nó còn khiến cho Pol xác định chính địa điểm chính thức phiên mã của gen. Tuy nhiên, dự trù chỉ có tầm khoảng 20% vùng phát động (promoter) ở người là đem vỏ hộp TATA. Do cơ, ở người TBP có lẽ rằng ko cần là prôtêin có một không hai tương quan cho tới xác định Pol II.
Một đặc thù nữa của TBP là mang trong mình một chuỗi lâu năm glutamine ở đầu N (đầu amin) của prôtêin này. Miền này kiểm soát và điều chỉnh hoạt động và sinh hoạt link gen của đầu C (đầu cacbôxyl) tác động cho tới vận tốc tạo hình tinh vi phiên mã và chính thức phiên mã. Đột phát triển thành thực hiện tăng số phen tái diễn CAG mã hóa chuỗi polyglutamine này rất có thể thực hiện tăng chiều lâu năm chuỗi cơ, tương quan cho tới spinocerebellar ataxia 17, tạo nên tha hóa thần kinh trung ương, đã và đang được gọi là căn bệnh polyglutamine.
TBP cũng là một trong những bộ phận của Pol I và Pol III và vì thế nhập cuộc vô quy trình chính thức phiên mã vì chưng cả tía loại Pol này. Trong những loại tế bào ví dụ hoặc bên trên những cơ hóa học ví dụ, thì TBP rất có thể được thay cho thế vì chưng một trong những một số trong những nhân tố tương quan cho tới TBP.^[13]
Vì TBP là một trong những nhân tố phiên mã cộng đồng quan trọng cho tất cả tía loại polymerase RNA phân tử nhân, nên nó là đề xuất nhằm phiên mã mang đến từng gen. Hiểu biết tường tận quan hệ động thân mật TBP với những vùng phát động bên trên gen ý nghĩa cần thiết so với nắm rõ vẹn toàn nhân những rối loàn DT vô DT nó học tập.

Hoạt động của TBP[sửa | sửa mã nguồn]

TBP Lúc đang được link với gen, nó sẽ bị link vô rãnh nhỏ của gen, gom tách chuỗi kép ở địa điểm đang được link, tương quan cho tới quy trình tách mạch kép bằng phương pháp uốn nắn cong đoạn gen ở trên đây một góc khoảng tầm 80 phỏng. Vị trí này là trình tự động nhiều A, T nên tạo nên ĐK mang đến quy trình tách mạch đơn giản rộng lớn là trình tự động nhiều G, C (hay X).
Sư biến dị đoan DNA ở địa điểm này vì thế TBP chèn chuỗi mặt mày những amino acid của chính nó vô trong số những cặp base. Sự link này xẩy ra vì thế lượng amino acid Lys (lyzin) và Arg (acginin) tích năng lượng điện dương của chính nó với những gốc phosphat tích năng lượng điện âm vô "xương sống" DNA là chuỗi link phôtphođieste. Do cơ đoạn này của DNA uốn nắn cong lại (sơ thiết bị bên dưới ở hình 1), những Phe (phênyl-alanin) luồn vô rãnh nhỏ của đoạn DNA này. Nhờ cơ, tương tác DNA-prôtêin được tăng mạnh.
Do đoạn DNA ngay gần vỏ hộp TATA nhiều A (ađênin) và T (timin), tuy nhiên cặp A-T chỉ mất nhì link hydro, nên đoạn DNA ở trên đây đơn giản tách nhau rời khỏi rộng lớn. Nhờ cơ, Pol đơn giản chính thức phiên mã gen.
TBP tạo nên link đặc hiệu với vỏ hộp TATA vì chưng nhì loại tương tác chất hóa học. Thứ nhất, chuỗi những amino acid nhiều lysine và arginine (các amino acid group kiềm) tạo hình link với gốc phosphate của những nucleic base. Đây đó là phương thức cơ phiên bản nhằm những prôtêin DBP rất có thể link với phân tử DNA. Tiếp cho tới, 4 phenyalanine bên trên những địa điểm đặc thù (thường là 99, 116, 190, và 207) của TBP sẽ khởi tạo trở nên cấu hình cặp vô không khí nhằm mục tiêu xen sở hữu vô rãnh nhỏ của phân tử DNA. Tương tác này gom TBP rất có thể bẻ gập phân tử DNA một cơ hội đơn giản. Bên cạnh đó, 2 asparagine ở đối xứng vô không khí (vị trí 69 và 159) đem kĩ năng tạo hình những link hydro với những base đặc hiệu của vỏ hộp TATA. Qua cơ, TBP rất có thể phân biệt và tạo nên link đúng chuẩn với vùng vỏ hộp TATA.
Xem them ở trang Phức ăn ý chi phí khởi điểm phiên mã đem tế bào miêu tả cả hoạt động và sinh hoạt của TBP ở nhân thực và nhân sơ.

Danh sách[sửa | sửa mã nguồn]

Một số loại TBP đã và đang được nghiên cứu và phân tích, nằm trong bọn họ prôtêin này liệt kê trên bảng sau:^[14]

Xem thêm: bilibili mod apk 2 30 0 vip unlocked download

Mã tên	Tên của prôtêin	Tên gen mã hoá	Loài	Dài
A0A1Q9P1X4_9ARCH	TATA-box-binding protein	tbp HeimC2_07150	Candidatus Heimdallarchaeota archaeon LC_2	233
A0A2D6G823_9ARCH	TATA-box-binding protein	tbp CMH64_03190	Nanoarchaeota archaeon	184
A0A368NA46_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp DU504_06645	Haloplanus salinus	181
A0A365T7W0_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp DMJ13_22240	halophilic archaeon	186
M0IL95_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp C441_05364	Haloferax sulfurifontis ATCC BAA-897	188
A0A0Q4B5D2_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp AOA80_07535	Methanomassiliicoccales archaeon RumEn M1	197
A0A2Z2HRR3_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp B1756_06695	Natronolimnobius aegyptiacus	186
A0A0P9FVB8_9ARCH	TATA-box-binding protein	tbp AOA65_1662	Candidatus Bathyarchaeota archaeon BA1	186
A0A365TEA5_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp DMJ13_02845	halophilic archaeon	186
M0CA54_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp C476_12286	Haloterrigena limicola JCM 13563	186
A0A371MTU7_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp DEQ92_19885	Haloferax sp. Atlit-6N	188
A0A1I0QJF4_9EURY	TATA-box-binding protein	tbpSAMN05216285_3651	Halopiger salifodinae	186
A0A284VPM0_9EURY	TATA-box-binding protein	MNV_270011	Candidatus Methanoperedens nitroreducens	73
A9A365_NITMS	TATA-box-binding protein	tbp Nmar_0598	Nitrosopumilus maritimus (strain SCM1)	186
A0A2E8BBD4_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp CMA67_03105	Euryarchaeota archaeon	204
A0A2D7BEP4_9EURY	TATA-box-binding protein	CMA12_02145	Euryarchaeota archaeon	157
A0A2E9PWQ0_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp CMA59_03840	Euryarchaeota archaeon	238
A0A2E7WZ17_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp CMA71_01780	Euryarchaeota archaeon	242
A0A2E1L9N1_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp CMA30_06600	Euryarchaeota archaeon	204
A0A2D9QNA4_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp CL979_02550	Euryarchaeota archaeon	237
A0A2E0VAJ0_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp CMA27_01435	Euryarchaeota archaeon	211
A0A2E2S9M9_9EURY	TATA-box-binding protein	CMB22_03860	Euryarchaeota archaeon	187
A0A2D7L8C8_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp CMA06_02405	Euryarchaeota archaeon	237
A0A2E8STT7_9EURY	TATA-box-binding protein	tbp CMA86_02495	Euryarchaeota archaeon	204